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三种不同形态太岁所含古菌的结构研究

文献类型： 中文期刊

作者： 王朝江 1 ; 王世清 2 ;

作者机构： 1.河北省农林科学院遗传生理研究所;石家庄市第四十四中学

2.;河北省农林科学院遗传生理研究所;石家庄市第四十四中学;

关键词： 太岁;不同形态;古菌;多样性;群落结构;高通量量测序

期刊名称： 生物技术

ISSN： 1004-311X

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 276-281

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]分析不同形态太岁中所含古菌多样性和群落结构。[方法]提取3种太岁深层组织样品的古菌DNA,进行16S r DNA PCR扩增后,利用Miseq平台进行测序统计。[结果]共得到有效序列92 849条,归类为5 161个OTU,属于2个门、5个目、11个属。21、82、91号3个样品中,广古菌门(Euryarchaeota)都是最优势门,所占比例分别是99.67%、98.79%和99.71%。甲烷杆菌属(Methanobacterium)、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)和甲烷球菌属(Methanosphaera)是丰度均排在前三位的属,所占比例之和依次是93.05%、84.16%和82.63%,其中甲烷杆菌属独自各占83.90%、47.14%、31.23%,其余两个属所占比例及其总量在不同形态太岁中不同。[结论]太岁中普遍含有古菌,优势类群为甲烷杆菌属、甲烷短杆菌属、甲烷球菌属,其在不同形态太岁所含古菌中占比范围在82.63%~93.05%之间。

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