您好,欢迎访问广东省农业科学院 机构知识库!

利用SNP和EST-SSR分子标记鉴定荔枝新种质御金球

文献类型: 中文期刊

作者: 孙清明 1 ; 李永忠 2 ; 向旭 1 ; 陈道明 1 ; 杨晓燕 1 ; 方静 1 ; 吴绪波 2 ; 周东辉 2 ; 马帅鹏 1 ; 马文朝 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院果树研究所

2.广东省珠海市果树科学技术推广站

关键词: 荔枝;新种质;分子鉴定;EST-SSR;SNP

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2013 年 003 期

页码: 403-414

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究利用自主开发的荔枝SNP和EST-SSR两种分子标记技术,对近年发掘的荔枝优稀种质御金球进行分子鉴定,明确其与现有的363份荔枝种质的亲缘关系,以探索其是否为新种质,并揭示亲本来源,为进行新品种保护提供分子证据.结果表明,13对EST-SSR引物在364份种质中共产生122条谱带,其中多态性条带112条(91.8%);筛选出的17对SNP引物均表现为二等位性.御金球与363份荔枝种质的演化分化系数介于0.043~1.924之间,遗传相似性系数介于0.123~0.877之间.可见,御金球与现有的363份荔枝种质在分子水平上存在差异,证实御金球为一份全新荔枝种质.通过对该种质与22份疑似亲本进行EST-SSR和SNP分析,并结合表型资料及品种起源信息,初步认为御金球是杂交后代,且母本为糯米糍,父本为焦核怀枝的可能性最大.SNP分型技术首次成功地用于荔枝新种质御金球的亲本来源鉴定,为今后荔枝种质的鉴别提供了可借鉴手段.

  • 相关文献

[1]荔枝新种质‘燎原’的分子标记鉴定. 刘伟,罗心平,张惠云,蒋侬辉,肖志丹. 2016

[2]利用EST-SSR分子标记鉴别荔枝新品种红灯笼. 向旭,欧良喜,白丽军,赵俊生,孙清明,陈洁珍,蔡长河. 2010

[3]中国96个荔枝种质资源的EST-SSR遗传多样性分析. 向旭,欧良喜,陈厚彬,孙清明,陈洁珍,蔡长河,白丽军,赵俊生. 2010

[4]荔枝两个F_1杂交群体的EST-SSR鉴定及多样性分析. 孙清明,马帅鹏,马文朝,赵俊生,方静,杨晓燕,向旭. 2014

[5]利用SNP标记鉴定荔枝杂种后代. 刘伟,肖志丹,蒋侬辉,杨晓燕,袁沛元. 2016

[6]一份富铁栽培稻新种质的发现. 李晨,涂从勇,刘军,潘大建,周汉钦,范芝兰. 2004

[7]De Novo Characterization of Leaf Transcriptome Using 454 Sequencing and Development of EST-SSR Markers in Tea (Camellia sinensis). Wu, Hualing,Chen, Dong,Li, Jiaxian,Qiao, Xiaoyan,Huang, Hualin,He, Yumei,Wu, Hualing,Chen, Dong,Li, Jiaxian,Qiao, Xiaoyan,Huang, Hualin,He, Yumei,Yu, Bo.

[8]Core EST-SSR Marker Selection Based on Genetic Linkage Map Construction and Their Application in Genetic Diversity Analysis of Litchi (Litchi chinensis Sonn.) Germplasm Resources. Xiang, X.,Chen, D. M.,Ma, S. P.,Ma, W. C.,Fan, J.,Yang, X. Y.,Liu, M.,Sun, Q. M.. 2014

[9]丝瓜(Luffa cylindrica)EST-SSR分子标记的验证及多态性分析. 骆彩霞,罗剑宁,赵钢军,何晓莉,周玲艳,吴海滨. 2020

[10]肇实转录组测序及生物信息学分析 被引量:1. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019

[11]肇实转录组测序及生物信息学分析. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019

[12]张溪香芋转录组测序及生物信息学分析. 王继华,罗群胜,梅瑜,杨少海. 2020

[13]基于EST-SSR标记的甘薯种质资源DNA指纹图谱构建. 罗忠霞,房伯平,李茹,王章英,黄立飞,陈景益,张雄坚,李育军,陈新亮,黄实辉. 2014

[14]甘薯EST资源的SSR信息分析. 黄立飞,房伯平,陈景益,张雄坚,罗忠霞. 2009

[15]广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析. 周炎花,乔小燕,马春雷,乔婷婷,金基强,姚明哲,陈亮. 2011

[16]广东仁化白毛茶优异株系遗传多样性的EST-SSR分析. 乔小燕,吴华玲,陈栋,李家贤,黄华林,晏嫦妤,何玉媚. 2010

[17]EST-SSR标记在蔬菜作物中的开发和应用进展. 吴海滨,罗少波,罗剑宁,龚浩,何晓莉. 2012

[18]CYP2C19基因与药物代谢相关性研究进展. 杜红丽,王靖方,崔建勋,凌飞,魏冬青,王小宁. 2008

[19]藏猪出生重的全基因组关联分析. 胡斌,蔡淑芳,孟繁明,辛海云,王塑天,李宝红,程蕾燕,李剑豪. 2021

[20]基于case-control法分析鸡脂肪性状QTL区域SNP与性状的关系. 唐军,王思兵,罗成龙,聂庆华,张细权. 2012

作者其他论文 更多>>