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尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨丽萍 1 ; 卢迈新 2 ; 叶星 2 ; 朱华平 2 ; 高风英 2 ; 莫媛媛 2 ; 黄樟翰 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所

2.中国水产科学研究院珠江水产研究所;广东海洋大学水产学院

关键词： 尼罗罗非鱼;线粒体基因组;丽鱼科;系统发育

期刊名称： 中国生物化学与分子生物学报

ISSN： 1007-7626

年卷期： 2010 年 26 卷 05 期

页码： 484-490

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 参照已报道的鱼类线粒体基因序列,通过PCR扩增与测序,获得了全长为16627bp的尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列,共编码13种蛋白质基因、2种rRNA基因、22种tRNA基因和1段控制区序列.H-链碱基组成具有明显的AT偏向性.由H-链编码的蛋白质基因在第3位密码子上相对于前2个密码子具有一定的G排斥性.L-链编码蛋白质基因在碱基组成上与H-链编码基因存在差异.编码基因除COI以GTG作为起始密码子外,其它均以ATG起始.终止密码子有2种,分别为不完全T-或TA-和TAA.L-链复制起始区位于WANCY区域(tRNATrp-tRNAAla-tRNAAsn-tRNACys-tRNATyr)的tRNAAsn和tRNACys基因间,长度为33bp.系统发育分析显示,源于非洲的口孵鱼属、蓝首鱼属和球丽鱼属聚为单系群,其中口孵鱼属莫桑比克罗非鱼先与同属罗非鱼KM-2006聚类后再与尼罗罗非鱼聚类.

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