文献类型： 中文期刊

作者： 庄静 ¹ ; 朱波 ² ; 金晓芬 ² ; 彭日荷 ² ; 乔玉山 ¹ ; 章镇 ¹ ; 熊爱生 ² ; 姚泉洪 ² ;

作者机构： 1.南京农业大学园艺学院

2.上海市农业科学院生物技术研究所

关键词： 转录因子;CBF;生物信息学;甘蓝型油菜‘沪油15'

期刊名称： 植物生理学通讯

ISSN： 0412-0922

年卷期： 2008 年 44 卷 06 期

页码： 1106-1112

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以拟南芥CBF家族转录因子AP2保守域的氨基酸序列为信息探针,搜索油菜UniGene数据库,得到2个UniGene:Bna. 2193和Bna.2260,序列拼接得到2个cDNA序列(BnaCBF-1和BnaCBF-2)。通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜‘沪油15'的DNA和cDNA中克隆了上述基因。序列分析显示,克隆的BnaCBF-1-Hy15与BnaCBF-1基因序列完全一样,而BnaCBF-2-Hy15与BnaCBF-2的基因序列差异很小,只有4个氨基酸位点不同,且都没有内含子。从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、序列比对、进化树、功能域、二级结构、三级结构进行了预测。结果显示,‘沪油15'来源的BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15转录因子属于AP2/ERF家族中的DREB-A1亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与atCBF1相似。