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三疣梭子蟹线粒体基因组SNP在增殖放流家系识别中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 赵莲 1 ; 李志辉 2 ; 张培 2 ; 薛蓓 2 ; 赖晓芳 2 ; 张庆起 2 ; 高焕 2 ; 阎斌伦 3 ;

作者机构: 1.淮海工学院海洋生命与水产学院江苏省海洋生物技术重点实验室;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心;江苏省农业种质资源保护与利用平台;连云港赣榆佳信水产开发有限公司

2.;淮海工学院海洋生命与水产学院江苏省海洋生物技术重点实验室;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心;江苏省农业种质资源保护与利用平台;连云港赣榆佳信水产开发有限公司

3.;淮海工学院海洋生命与水产学院江苏省海洋生物技术重点实验室;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心;江苏省农业种质资源保护与利用平台;连云港赣榆佳信水产开发有限公司;

关键词: 三疣梭子蟹;增殖放流;分子标志;SNP;HRM

期刊名称: 渔业科学进展

ISSN: 2095-9869

年卷期: 2018 年 02 期

页码: 156-163

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为开发三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)增殖放流分子标志技术,本研究在前期获得三疣梭子蟹线粒体基因组24个SNP位点的基础上,采用高分辨率熔解曲线(HRM)检测技术对4个用于增殖放流的家系(A、B、C和D)(代表约80~120万个放流个体)进行了鉴别工作。结果显示,含有SNP位点的22条PCR扩增序列中,有9条SNP位点扩增产物在亲代(母本)及其子代的28个个体之间具有基本一致的熔解峰,且子代个体间Tm的均一性较好,无明显差异;进一步以序列已知的野生型及其突变体作为同一SNP引物扩增片段,在各家系间分析HRM标准曲线,这9个SNP可以成功用于三疣梭子蟹4个放流家系的鉴别。在这9个SNP位点中,可鉴定C家系的有5个,可鉴定B家系的有2个,可鉴定A、D家系的各1个。该研究结果为三疣梭子蟹种质资源的鉴定及标志放流工作的开展提供了技术支持。

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