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水稻簇生穗基因CPB4的精细定位

文献类型: 中文期刊

作者: 姜玲 1 ; 姜宁 1 ; 曹黎明 1 ; 董世青 1 ; 杨金水 1 ; 陆平利 1 ; 罗小金 1 ;

作者机构: 1.复旦大学生命科学学院遗传学研究所;复旦大学遗传工程国家重点实验室;复旦大学生命科学学院生物统计系;上海市农业科学院作物育种栽培研究所

关键词: 水稻;簇生穗;精细定位;CPB4;油菜素内酯

期刊名称: 复旦学报(自然科学版)

ISSN: 0427-7104

年卷期: 2018 年 06 期

页码: 757-766

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究鉴定了一个穗型突变体T637,表现为簇生穗型,穗粒数减少,结实率降低,籽粒变小,千粒重下降.遗传分析发现穗型突变由隐性单基因控制;通过基因芯片检测和SSR标记分析最终将目标基因定位在第4号染色体标记RM2439和RMZL74之间1.3 Mb范围内.随后通过全基因组重测序,发现突变体中LOC_Os04g39430基因第4外显子上有一段4 262 bp序列插入,因此确定其为候选基因,并命名为CPB4(CLUSTERED PRIMARY BRANCH 4).通过分析亚洲栽培稻特青(O.sativa L.)和T637对不同浓度24-epiBL(24-表油菜素内酯)的敏感程度,确认T637为油菜素内酯敏感型突变体.qRT-PCR分析表明,突变体T637中BR生物合成相关基因D2和BRD2以及BR信号转导相关基因BRI1,OsBAK1,OsLIC1,TUD1,BU1在幼穗中的表达量均显著降低.

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