文献类型： 中文期刊

作者： 李清 ¹ ; 罗永坚 ¹ ; 吴柔贤 ¹ ; 贾俊婷 ¹ ; 张文虎 ¹ ; 宋松泉 ¹ ; 刘军 ¹ ;

作者机构： 1.广东省农业科学院农业生物基因研究中心/广东省农作物种质资源保存与利用重点实验室

关键词： 大豆;SSR;遗传多样性;分子身份证;聚类分析

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2020 年 47 卷 012 期

页码： 221-228

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]对广东省大豆资源进行遗传多样性分析,筛选有效的SSR分子标记,以及构建快速鉴定的DNA分子身份证.[方法]收集了广东省19个市37个县市共96份大豆种质资源,提取基因组DNA后,利用30对SSR引物进行PCR扩增,通过测序检测获得相关多态性结果进行聚类分析以及DNA分子身份证构建,记录相关品种性状并转化为可视化信息.[结果]毛细管电泳检测结果表明,30对SSR引物在96份大豆材料之间均具有清晰稳定的多态性片段,共扩增出273个多态性等位变异片段,平均每对引物扩增出多态性等位变异片段数14.29个;不同引物揭示的多态性信息含量(PIC)的范围为0.3891~0.9310,平均值为0.6786,30对引物可用于区分广东大豆资源.通过聚类分析发现,所收集的大豆样品可以分为3个类群,具有遗传多样性.从PIC最高者开始进行引物组合,筛选出6对能将96份大豆区分开的引物.[结论]基于6对SSR引物扩增结果,对多态性片段排序,通过数字与英文结合编码,成功构建96份大豆资源的DNA分子身份证,为广东省大豆种质资源鉴定提供了重要依据.