文献类型： 中文期刊

作者： 王建丽 ¹ ; 曲洪生 ² ; 尤佳 ¹ ; 钟鹏 ³ ; 邸桂俐 ¹ ; 韩微波 ¹ ; 申忠宝 ¹ ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院草业研究所

2.中商艾享生态科技股份有限公司

3.黑龙江省农业科学院农村能源与环保研究所

关键词： 羊草;LcCOMT;生物信息学分析;荧光定量表达

期刊名称： 黑龙江农业科学

ISSN： 1002-2767

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 15-23

摘要： 为初步解析羊草[Leymus chinensis(Trin.)Tzvel.]木质素合成的分子机制,依据前期转录组数据,以羊草茎cDNA为模板,克隆获得了羊草COMT基因,将其命名为LcCOMT.LcCOMT基因的开放阅读框(ORF)全长为1065 bp,编码354个氨基酸,分子量为38.068 kDa,等电点为5.62.生物信息学分析显示,L cCOM T基因编码氨基酸序列中包含2个保守的结构域,分别为二聚化结构域与和甲基转移酶结构域,但无信号肽和跨膜结构域.系统进化分析表明,LcCOMT与大麦(Hordeum vulgare)、粗山羊草(Aegilops taus-chii)的COM T基因亲缘关系最近,氨基酸序列一致性均在95% 以上.同源建模发现,LcCOM T的3D模型与多年生黑麦草(Lolium perenne)LpOMT1蛋白序列相似性达到了87.85%,同源性较高,推测其可能与LpOM T1具有相似的功能.组织表达分析显示,LcCOM T在叶片、叶鞘和茎节中均有表达,但茎中表达量最高,且在同一茎节中随着生殖期的延长表达量增加.L cCOM T基因的克隆和表达分析为下一步基因功能研究奠定了基础.