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大蒜全基因组ABCB基因鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李梦倩 1 ; 樊继德 1 ; 葛洁 1 ; 杨青青 1 ; 陆新娟 1 ; 赵永强 1 ; 刘灿玉 1 ; 张碧薇 1 ; 刘光杨 1 ; 杨艳 1 ; 杨峰 1 ;

作者机构: 1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所

关键词: 大蒜;ABCB基因家族;体细胞胚

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2024 年 40 卷 012 期

页码: 2207-2218

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究生长素转运蛋白ABCB基因(AsaABCB)在大蒜体细胞胚发生过程中的作用机理,以徐蒜6号为试验材料,采取生物信息学方法,对大蒜AsaABCB基因家族成员进行全基因组鉴定,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术进行胚发育过程中AsaABCB家族基因表达模式分析。结果表明,大蒜中共存在17个AsaABCB基因,定位在7条染色体上,在系统进化树上可分为5个亚组。AsaABCB基因编码的氨基酸数量为545~1 379个,相对分子量为59 627.17~152 864.21,理论等电点为5.72~9.34。AsaABCB4、AsaABCB6、AsaABCB15蛋白定位于细胞膜和细胞质中,其余AsaABCB蛋白仅定位于细胞膜。17个AsaABCB基因的启动子区存在196个光反应元件、48个茉莉酸反应调控元件、26个脱落酸反应元件及12个生长素响应元件。11个AsaABCB家族基因在大蒜胚性愈伤组织(EC)阶段相对表达量较高,5个AsaABCB家族基因在愈伤组织(CA)阶段表达量较高,这表明该家族基因可能主要调控大蒜体细胞胚发育过程中EC和CA的形成与发育。本研究结果为深入探索大蒜体细胞胚发育过程中AsaABCB基因的功能奠定基础。

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