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结合线粒体D-loop序列和SSR标记对宝石鲈养殖群体遗传多样性的分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵立祥 1 ; 董浚键 1 ; 孙成飞 1 ; 田园园 1 ; 胡婕 1 ; 卢迈新 1 ; 叶星 1 ;

作者机构: 1.农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室

关键词: 宝石鲈(Scortum barcoo);D-loop;微卫星;遗传多样性;遗传距离

期刊名称: 淡水渔业

ISSN: 1000-6907

年卷期: 2019 年 49 卷 003 期

页码: 37-46

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用线粒体D-loop序列及SSR标记分析广东4个宝石鲈(Scortum barcoo)养殖群体的遗传多样性.D-loop序列分析显示,长度为598 bp的D-loop片段上有14个多态性位点,共定义8个单倍型.4个群体单倍型多样性指数、 核苷酸多样性指数分别为0.0000~0.5435、0.00000~0.00176,表明4个群体遗传多样性水平均较低.利用11个SSR位点分析显示,4个群体期望杂合度(He)=0.396~0.516、PIC=0.320~0.420,说明各群体遗传多样性处于中低水平.虽然二种方法获得的遗传分化指数FST上存在差异,分别为0.4035(D-loop)和0.0445(SSR),但二种分析结果均显示4个广东群体的遗传多样性较低、 亲缘关系较近,因此有必要引进原种以丰富国内养殖群体的遗传多样性.

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