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黄条生长性状全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 崔爱君 1 ; 徐永江 1 ; 王滨 1 ; 姜燕 1 ; 柳学周 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

关键词： 黄条;生长性状;全基因组关联分析;2b-RAD;简化基因组

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 71-78

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用2b-RAD技术对119尾黄条（Seriola lalandi）个体进行测序,共获得黄条SNP分子标记26665个,对黄条个体的体质量和全长这2个重要生长性状进行全基因组关联分析,筛选与体质量和全长性状相关的SNP位点和候选基因。结果显示,黄条体质量性状中共筛选到17个体质量显著关联的SNP位点,找到17个可能的候选基因,全长性状共筛选到12个潜在显著关联位点,找到12个可能的候选基因。利用KEGG数据库对可能的候选基因进行Pathway分析,得知候选基因主要参与了细胞或组织生长发育相关的代谢通路调控过程,可能是影响黄条生长性状密切相关的重要候选SNP位点和功能基因,结果可为今后黄条种质资源可持续利用和育种提供遗传信息资料积累。

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