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新疆野扁桃AlsCBF1-A基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 代培红 1 ; 郭龙 2 ; 李月 1 ; 姚正培 1 ; 罗淑萍 1 ;

作者机构： 1.新疆农业大学农学院

2.新疆农业大学农学院新疆农业科学院园艺作物研究所新疆农业大学林学与园艺学院

关键词： 野扁桃;转录因子;CBF基因;抗寒

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 14 卷 01 期

页码： 71-76

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以野扁桃为实验材料,提取叶片的RNA,设计基因特异性引物,利用RT-PCR克隆转录因子CBF的c DNA全长,命名为Als CBF1-A(登录号KU975456);并对其基因和蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,该转录因子基因的CDS区长699 bp,编码232个氨基酸,编码蛋白相对分子质量约为26.027 2 k D,p I 4.84;由无规则卷曲(C),α-螺旋(H),β-折叠(E)组成,分别占52.17%,21.74%和26.09%;有较强的亲水性,无跨膜区和信号肽存在,有8处丝氨酸磷酸化位点、2处苏氨酸磷酸化位点、2处酪氨酸磷酸化位点;同源性分析表明Als CBF1-A基因在高等植物中保守性较高。本研究显示CBF转录因子可能与野扁桃的抗寒性相关,此研究为野扁桃抗寒分子机理的进一步研究提供了帮助。

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