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一株新种气单胞菌噬菌体phiA050的生物学特性和全基因组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘虹彤 1 ; 陈躬浩 1 ; 涂传灯 2 ; 江兴龙 1 ; 蔡鸿娇 1 ; 郑江 1 ; 房文红 3 ; 翁齐彪 4 ; 林茂 1 ;

作者机构: 1.集美大学水产学院

2.厦门海洋职业技术学院

3.中国水产科学研究院东海水产研究所

4.福建省鳗鱼养殖与加工重点实验室

关键词: 气单胞菌;噬菌体;生物学特性;全基因组

期刊名称: 中国生物工程杂志

ISSN: 1671-8135

年卷期: 2025 年 45 卷 001 期

页码: 24-37

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的:分离气单胞菌噬菌体并研究其特性,为气单胞菌的噬菌体防治提供理论基础。方法:以嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)A050为宿主菌筛选噬菌体,利用双层平板法研究噬菌体一步生长曲线、最佳感染复数和稳定性等生物学特征;通过电镜观察噬菌体形态;利用Illumina Hiseq平台进行噬菌体基因组测序,利用在线工具Blastn、CGView、VipTree、VIRIDIC和Mauve软件进行生信分析。结果:分离得到一株新种噬菌体phiA050,其噬菌斑透明、无晕圈,直径为(0.10±0.02)cm;电镜观察显示,phiA050头部为正廿面体,直径为(70.8±2.7)nm,尾长为(71.3±3.7)nm;宿主谱检测结果显示,phiA050可裂解68株气单胞菌中的19株;phiA050对宿主气单胞菌A050的最佳感染复数为0.001,一步生长曲线显示其潜伏期为30 min,裂解量为158 PFU/cell; phiA050耐受的pH范围在4~10之间,耐受温度可达50℃(1 h),60℃时只有少量存活;phiA050基因组全长53 322 bp, GC含量为44.75%,注释出61个开放阅读框(open reading frame, ORFs);Blastn序列比对发现,phiA050与最近源的欧文氏菌噬菌体Faunus总相似度仅为36.30%,根据国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)最新的病毒分类标准,噬菌体phiA050应归于新属新种。结论:分离得到一株新种噬菌体phiA050,该噬菌体与现有数据库中噬菌体相似性低,具有独特的研究价值和应用前景。

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