文献类型： 中文期刊

作者： 刘邦辉 ¹ ; 郁二蒙 ¹ ; 王广军 ¹ ; 余德光 ¹ ; 谢骏 ¹ ; 王海英 ¹ ; 龚望宝 ¹ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所

关键词： 草鱼;Ⅰ型胶原蛋白;COL1A1;组织分布;生物信息学

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2012 年 36 卷 06 期

页码： 52-61

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用PCR和RACE方法首次克隆了编码草鱼肌肉Ⅰ型胶原蛋白的α1基因(COL1A1)的cDNA全长序列,为5772bp,其开放阅读框为4347bp,编码1448个氨基酸。BLAST同源性分析结果显示,草鱼COL1A1基因的氨基酸序列与斑马鱼、金鱼同源性较高,分别为93.90%和93.60%,呈现出较高的保守性。系统进化树分析表明,该基因与斑马鱼、金鱼处于同一支,亲缘性最近。生物信息学分析显示,草鱼COL1A1蛋白质的相对分子质量为137.2ku,理论等电点是5.44,为α螺旋β折叠三重螺旋结构蛋白。有18段三重螺旋重复域,22段低复杂度域,17个功能域。COL1A1蛋白有33～69,1249～1355两个绑定钙的区域和62～104一个绑定锌的区域。利用半定量RT-PCR方法检测的组织表达结果表明,COL1A1基因在草鱼肌肉、肠道、肝胰脏、鳃、皮肤、鳍条、肾脏和脾脏8个组织中均有表达,其中在皮肤、鳃、肾脏、鳍条组织中的mRNA表达量高于其他4个组织(P<0.05)。