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斑点叉尾GHRH基因3个SNPs位点及其单倍型组合与生长性状的关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张世勇 1 ; 钟立强 2 ; 秦钦 2 ; 王明华 2 ; 潘建林 2 ;

作者机构: 1.江苏省淡水水产研究所江苏省农业种质资源保护与利用平台

2.江苏省淡水水产研究所

关键词: 斑点叉尾;GHRH;SNP;SNaPshot;生长性状;单倍型分析;关联分析

期刊名称: 水生生物学报

ISSN: 1000-3207

年卷期: 2016 年 05 期

页码: 886-893

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 研究旨在探讨生长激素释放激素基因(Growth hormone-releasing hormone,GHRH)对斑点叉尾(Ictalurus punctatus)生长性状的影响。采用DNA混池测序法筛选GHRH基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,使用SNa Pshot法将筛选到的SNPs多态性位点进行分型,并对这些位点进行连锁不平衡和单倍型分析。结果表明,在GHRH基因内含子区域共检测到4个SNPs位点,并成功地对3个位点进行了分型,3个位点间均不存在强连锁不平衡;3个SNPs位点在176尾斑点叉尾中形成了6种有效单倍型。关联分析表明SNP位点g.6301 G>A的AA基因型的体质量显著性地高于AG和GG型(P<0.05),比群体的平均体质量高14%。单倍型组合H1/H4和H1/H5个体的体质量和体长极显著性地高于其他单倍型组合(P<0.01),体质量比群体平均体质量分别高30%和15%,体长比群体平均体长分别高7%和6%。研究为斑点叉尾生长性状分子标记辅助选育和QTL定位提供了参考依据。

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