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基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构

文献类型: 中文期刊

作者: 孙鹏 1 ; 尹飞 2 ; 施兆鸿 2 ; 彭士明 2 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院东海水产研究所

2.中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室

关键词: 鲳属鱼类(Pampus);细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COI);序列变异;系统进化

期刊名称: 海洋科学

ISSN: 1000-3096

年卷期: 2012 年 36 卷 06 期

页码: 15-21

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COI)部分序列研究了南海区鲳属鱼类(Pampus)银鲳(P.ar-genteus)、珍鲳(P.minor)和中国鲳(P.chinensis)的系统进化与种群遗传结构。通过PCR扩增与序列测定获得了长度为643 bp的COI基因片段,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为25.4%、33.6%、18.9%和22.1%,A+T含量高于G+C含量。64条序列共定义了20种单倍型,包含152个变异位点,简约信息位点148个,单变异位点4个,产生169个点突变。结果表明,银鲳与中国鲳的遗传差异最小,银鲳与珍鲳的其次,而珍鲳与中国鲳的遗传差异最大,3种鲳属鱼类的遗传多样性均呈现较低的水平,应采取有效的保护措施,以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果为鲳属鱼类资源保护和合理开发利用提供必要的参考。

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