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水稻粒长基因GS3和qGL3功能标记的设计及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 张亚东 1 ; 郑佳 2 ; 赵春芳 2 ; 陈涛 2 ; 赵庆勇 2 ; 朱镇 2 ; 周丽慧 2 ; 姚姝 2 ; 赵凌 2 ; 于新 2 ; 王才林 2 ;

作者机构: 1.南京农业大学农学院

2.江苏省农业科学院粮食作物研究所

关键词: 水稻;GS3基因;q GL3基因;序列差异;四引物ARMS-PCR标记

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2014 年 06 期

页码: 1191-1197

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 水稻粒型是与其产量直接相关的重要性状。在前期研究证实来源于特大粒水稻TD70和籼稻品种Kasalath的重组自交系(RIL)群体中检测到已克隆的粒长GS3和q GL3基因的基础上,通过TD70和Kasalath的GS3、q GL3基因序列差异分析,设计功能标记,检测240个RILs和不同粒长的6个粳稻、9个籼稻中GS3、q GL3基因类型及其效应。结果显示:TD70和Kasalath中的GS3基因和q GL3基因分别在第2外显子上的编码区+165位置和第10外显子上的编码区+1 092位置存在一个由碱基C到碱基A的单核苷酸替换,据此设计了四引物扩增受阻突变体系(Tetra-primer ARMS-PCR)标记,TD70的GS3和q GL3基因分别扩增为270 bp和145 bp条带及448 bp和288bp条带,Kasalath的GS3、q GL3基因分别扩增为270 bp和175 bp条带及448 bp和216 bp条带;240个RILs中含有GS3-T和q GL3-T基因的株系61个,含GS3-T和q GL3-K的株系48个,含GS3-K和q GL3-T的株系17个;不同粒型基因组合的粒长存在显著差异,表现为GS3-T+q GL3-T>GS3-T+q GL3-K或GS3-K+q GL3-T>GS3-K+q GL3-K;长粒型的1个粳稻和5个籼稻品种的GS3基因表现为TD70带型,短粒型的5个粳稻和4个籼稻品种的GS3基因表现为Kasalath带型;所有水稻品种的q GL3基因均表现为Kasalath带型。表明开发的GS3和q GL3基因功能标记是有效的,可用于水稻分子标记辅助育种。

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