文献类型： 中文期刊
作者： 徐黎明 1 ; 刘红柏 1 ; 尹家胜 1 ; 卢彤岩 1 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
关键词： 传染性造血器官坏死病毒;糖蛋白;生物信息学分析;IHNV基因型
期刊名称： 中国水产科学
ISSN： 1005-8737
年卷期： 2014 年 21 卷 01 期
页码： 180-188
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用鲤(Cyprinus carpio)上皮细胞(epitheliaoma papulosum cyprini,EPC)培养传染性造血器官坏死病毒-Sn1203分离株(IHNV-Sn1203),根据GenBank中IHNV G蛋白基因开放阅读框(open reading frame,ORF)的序列设计引物(GenBank序列编号AB288207),采用RT-PCR的方法克隆得到IHNV-Sn1203株G蛋白全长ORF,克隆至表达载体pET27b(+)中,构建了pET27-G重组质粒,并进行了测序分析。生物信息学分析结果显示,IHNV-Sn1203株G蛋白基因序列长度为1 527 bp,与韩国株具有最高的核酸同源性(96.86%)和氨基酸同源性(97.05%)。该基因编码508个氨基酸残基,推导分子量约为56.55 kD,等电点为6.15;氨基酸序列分析表明,G蛋白富含丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸,存在28个潜在的磷酸化位点;存在4个潜在的N-糖基化位点和7个潜在的O-糖基化位点;G蛋白N端含有20个氨基酸的信号肽;亲水性大于输水性;位于483~508位氨基酸存在一跨膜区;抗原表位预测显示抗原性良好;系统进化树分析显示,IHNV-Sn1203株与日本株和韩国株聚为一簇,都属于JRt基因型。
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