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猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王隆柏 1 ; 林裕胜 1 ; 车勇良 1 ; 吴学敏 1 ; 陈如敬 1 ; 邵良平 2 ; 周伦江 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

2.福建农林大学动物科学院

关键词: 猪流行性腹泻病毒;S基因;N基因;ORF3基因;变异分析

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2014 年 45 卷 11 期

页码: 1830-1836

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探明2012—2013年在福建省流行猪流行性腹泻病毒(PEDV)结构蛋白的遗传变异情况,对7株PEDV流行毒株的S、N及ORF3基因进行克隆、测序及分析。结果表明:7株PEDV S基因之间的核苷酸相似性为98.6%~99.4%,与attenuated DR13弱毒株和CV777标准株的相似性分别为93.7%~94.1%和93.8%~94.1%;同CV777标准株比较,存在64个氨基酸突变,其中有3个氨基酸较以往国内外流行毒株的变异不一样,为新变异氨基酸,氨基酸的插入和缺失与2008年泰国NPPED2008_2株相似;7株PEDV毒株的N基因和ORF3基因之间核苷酸的相似性分别为96.5%~99.7%和99.7%~100%,与CV777标准株的相似性分别为96.6%~98.0%和96.6%~96.9%。遗传进化树表明:7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因与泰国流行毒株的亲缘关系较近,N基因与CV777标准株亲缘关系较近。7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因变异程度较大,可能源于泰国及韩国的变异株。

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