文献类型： 中文期刊

作者： 肖英平 ¹ ; 何祥祥 ¹ ; 戴宝玲 ¹ ; 桂国弘 ¹ ; 唐标 ¹ ; 杨华 ¹ ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院农产品质量标准研究所浙江省植物有害生物防控省部共建国家重点实验室培育基地;西北农林科技大学食品科学与工程学院

关键词： 冷鲜鸡;菌群结构;涂抹法;冲洗法;高通量测序

期刊名称： 食品科学

ISSN： 1002-6630

年卷期： 2017 年 24 期

页码： 260-264

收录情况： EI ; 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的:比较涂抹法和冲洗法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响。方法:将4只冷鲜鸡对半分开,分别采用涂抹法和冲洗法采集其表面微生物,提取基因组DNA,对细菌16S rRNA基因V3~V4区进行聚合酶链式反应扩增,通过Illumina Hiseq测序平台对扩增产物进行高通量测序,使用QIIME等软件对测序序列进行分析统计。结果:两种方法采集的样品在细菌基因组DNA提取、菌群丰富度、多样性及菌群结构等方面均无显著差异(P>0.05)。高通量测序结果表明,冷鲜鸡表面细菌菌群主要分布于7个门,10个属。变形菌门为优势菌门,占70%以上;希瓦氏菌属、假单胞菌属、不动杆菌属、嗜冷杆菌属和环丝菌属为优势菌属,分别占10%~20%。结论:两种采样方法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序没有明显影响,但冲洗法比涂抹法简单易行,且不易发生二次污染,因此更具有实用性。本实验同时也为冷鲜鸡表面细菌的研究提供了数据资料。