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海洋微生物ZD02信号降解酶基因aiiA克隆及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 丁贤 1 ; 孙威文 2 ; 张殿昌 1 ; 翁雄 1 ; 林黑着 1 ; 周世宁 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源开发利用重点实验室

2.中山大学生命科学学院有害生物防治与资源利用国家重点实验室

关键词： 海洋细菌;群体感应信号降解酶;aiiA基因

期刊名称： 生态学杂志

ISSN： 1000-4890

年卷期： 2013 年 32 卷 08 期

页码： 2056-2061

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据细菌群体感应信号降解酶(AiiA)基因设计简并引物,从海洋微生物ZD02基因组中扩增编码AiiA的基因aiiA,筛选其阳性克隆,测序后分析其基因序列。结果表明:筛选到的阳性克隆ZD02-aiiA序列全长753bp(Genbank登录号:KC756214),存在一个开放阅读框(ORF),编码由250个氨基酸残基组成的多肽,预测分子量为28.1kDa,蛋白等电点为4.78。由该序列推导得到的氨基酸残基序列含有一个保守结构域(Lactamase-B)(34AA～235AA),并预测了AiiA的三级结构。以上研究为该序列的重组表达及其相关活性研究奠定了基础。

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