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黄、渤海鱼类DNA条形码信息平台构建及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 曲欣宇 1 ; 刘璐 1 ; 李纯厚 1 ; 王晨阳 1 ; 彭子为 1 ; 刘敏姝 1 ; 焦天琪 1 ; 陈治 1 ; 樊鑫 1 ;

作者机构: 1.山东交通学院;中国水产科学研究院南海水产研究所;海南热带海洋学院热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室;海南热带海洋学院海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室

关键词: 鱼类;数据平台;DNA条形码;物种鉴定

期刊名称: 水产学杂志

ISSN: 1005-3832

年卷期: 2022 年 35 卷 006 期

页码: 37-44

收录情况: 北大核心

摘要: 本研究在采集黄渤海鱼类生物凭证标本及相应DNA条形码的基础上,结合GenBank序列,采用BLAST分析进行数据校正分析、构建系统树检验和Barcoding Gap校验防错等方法核验所采用条形码的可靠性,通过统一提交数据的规范格式,实现物种、凭证标本和DNA条形码的相互关联,构建了黄、渤海鱼类DNA条形码信息平台(http://www.fishdna.com.cn/).该平台数据信息由物种文献数据库、标本数据库和DNA条形码数据库组成,涵盖300余种鱼类的基本生物学信息和DNA条形码资源.平台能提供快捷直观的互联网查询,通过DNA条形码实现未知鱼类样本的物种查询和鉴定.本研究首次构建针对黄、渤海地区的重要鱼类生物的DNA条形码信息平台,访问该网站平台能认知未知鱼类样本,促进国内各海域、各地区乃至国外数据共享和合作交流,为我国北方主要经济鱼类生物分类鉴定、种质资源的开发利用、濒危海洋鱼类的保护和经济鱼类物种甄别提供重要数据资源.

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