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鲩肠袋虫18S rDNA的扩增、测序与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李明 1 ; 王崇 2 ; 汪建国 3 ; 喻达辉 1 ; 王文博 1 ; 戈贤平 4 ; 徐跑 4 ; 谢骏 4 ; 龚小宁 3 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

2.水利部中国科学院水工程生态研究所

3.中国科学院水生生物研究所

4.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

关键词: 鲩肠袋虫;18S rDNA;系统发育

期刊名称: 水生生物学报

ISSN: 1000-3207

年卷期: 2011 年 35 卷 02 期

页码: 203-209

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 研究测定了寄生于草鱼肠道的鲩肠袋虫的18S rDNA序列。鲩肠袋虫的18S rDNA基因序列包括1638个碱基。分别用3种分析方法(邻接法、最大简约法、贝叶斯法)构建了毛口亚纲的系统发育树,得到结果如下:均支持毛口亚纲为单系发生且内分前庭目、内毛目和澳大利亚枝3个类群(100%Bay、100%MP、100%NJ);均支持内毛目(100%Bay、98%MP、93%NJ)、澳大利亚枝(100%Bay、97%MP、99%NJ)的单系性和前庭目的并系性。3种构树方法都支持鲩肠袋虫与澳大利亚枝聚类(100%Bay、100%MP、100%NJ),而后与"内毛目+前庭目(部分)"构成姊妹群(100%Bay、85%MP、72%NJ);而结肠小袋纤毛虫与"澳大利亚枝+鲩肠袋虫"以及"内毛目+前庭目(部分)"分枝并列,共同构成毛口亚纲(100%Bay、100%MP、100%NJ)。这暗示了肠袋虫类群在系统发育上的并系性和其分类阶元的提升。

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