文献类型： 中文期刊
作者： 赵凌 1 ; 梁文化 1 ; 赵春芳 1 ; 魏晓东 1 ; 周丽慧 1 ; 姚姝 1 ; 王才林 1 ; 张亚东 1 ;
作者机构： 1.江苏省农业科学院粮食作物研究所/国家水稻改良中心南京分中心/国家耐盐碱水稻技术创新中心华东中心/江苏省优质水稻工程技术研究中心
关键词： 水稻;重组自交系;高密度Bin图谱;抽穗期;QTL
期刊名称： 作物学报
ISSN： 0496-3490
年卷期： 2023 年 49 卷 001 期
页码： 119-128
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 挖掘新的控制水稻抽穗期相关位点和候选基因,对抽穗期的遗传机制研究和品种改良具有重要的意义.利用抽穗期存在明显差异的粳稻TD70和籼稻Kasalath杂交衍生的包含186个家系的重组自交系群体,构建了基于深度重测序的高密度Bin遗传图谱,图谱共包含12,328个Bin标记.RIL群体及亲本2018年和2021年正季种植于江苏省南京市江苏省农业科学院.以家系从播种到抽穗所经历的天数作为抽穗期表型值,使用IciMapping软件3.4版的完备区间作图法,对控制水稻抽穗期的QTL进行鉴定.2年共检测到15个抽穗期的QTL,分布在3号、6号、7号、8号、10号和12号染色体上,LOD值为2.58~10.68,其中7个QTL和已知抽穗期QTL的位置存在重叠或者部分重叠.共有4个QTL在2年均检测到,表现出较强的稳定性.对2年重复鉴定到的4个QTL区间进行基因功能注释和亲本间序列分析,共发现7个注释有功能,且在2个亲本间编码区存在非同义突变的基因.根据候选基因SNP的类型对RIL群体家系进行基因等位型分类和效应分析,发现4个基因其不同等位型的RIL家系在抽穗期上存在显著或者极显著差异,推测可能为候选基因,可用于后续水稻抽穗期的分子机制研究.
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