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基于金针菇全基因组的赖氨酸合成途径关键酶分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘建雨 1 ; 王瑞娟 1 ; 张丹 1 ; 尚晓冬 1 ; 谭琦 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院食用菌研究所农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点实验室

关键词： 金针菇;赖氨酸生物合成;α-氨基己二酸途径

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2016 年 43 卷 10 期

页码： 2225-2233

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】以金针菇全基因组测序数据为基础研究其L-赖氨酸的从头合成途径及其关键基因。【方法】采用Illumina Hiseq2000和Roche454 FLX+两种方法完成金针菇单孢菌株Dan3的基因组测序,基于全基因组序列筛选金针菇中赖氨酸生物合成的关键基因,并分析这些基因编码的蛋白质基本理化性质;预测其亚细胞定位情况及蛋白的二级结构。【结果】金针菇Dan3全基因组序列长度为34.17 Mb,预测到8个参与α-氨基己二酸途径的关键基因,这些基因都含有多个内含子和外显子,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,有3个蛋白定位于线粒体。【结论】金针菇是通过α-氨基己二酸途径合成赖氨酸,基因组中预测到与该途径相关的几乎所有的酶。

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