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合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 李小宁 1 ; 张殿昌 1 ; 朱彩艳 1 ; 苏天凤 1 ; 江世贵 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词： 合浦珠母贝;微卫星;分子标记;多态性位点

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2009 年 37 卷 15 期

页码： 93-96+116

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]研究合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选。[方法]采用生物素标记的5个探针,用磁珠富集法构建合浦珠母贝基因组微卫星富集文库,并对文库进行筛选、测序与引物多态性筛选。[结果]对500个克隆进行PCR筛选,测序分析发现130个克隆含有微卫星重复单元。序列比对后最终获得109个具有特异微卫星序列的阳性克隆,其中包含179个微卫星DNA结构域。基于微卫星两端的侧翼序列设计并获得了13对能够在合浦珠母贝基因组有效扩增的微卫星引物,其中8对在种群中(n=32)具有扩增多态性,其多态信息含量PIC值在0.239~0.787;等位基因数在2~9个;观测杂合度介于0.22~0.56;期望杂合度的变化范围为0.25~0.83。[结论]这研究为进一步开展合浦珠母贝的遗传分析提供了基础资料。

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