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不同物种ATGL基因部分序列的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨红文 1 ; 粟朝芝 1 ; 王春凤 1 ; 韦毕芬 1 ;

作者机构： 1.贵州省畜牧兽医研究所

关键词： ATGL基因;生物信息学;遗传多样性;分子系统进化

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2008 年 36 卷 29 期

页码： 12624-12626

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]深入了解ATGL基因的遗传多样性以及不同物种ATGL基因间的分子系统进化关系。[方法]应用比较基因组学和生物信息学方法分析了8个物种ATGL基因的遗传多样性和分子系统进化。[结果]32条基因序列共检测到77个多态位点,发现12种单倍型。各物种间核苷酸歧异度和净遗传距离分别在0.005 48~0.197 37和0.004 39~0.197 37。分子系统进化树结果显示,人、猕猴、黑猩猩之间以及挪威鼠和家鼠之间的亲缘关系较近,而狗、牛与家鼠间的亲缘关系较远。人、家鼠和猪的非同义替换位点数明显高于同义替换位点数。各同源ATGL基因的有效密码子数和密码子偏爱指数分别在27.618~38.016和0.643~0.807。[结论]该结果为进一步研究AT-GL基因的生物学功能和确定动物脂肪沉积及肉质性状的候选分子标记提供了基础资料。

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