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基于高通量测序技术分析微冻凡纳滨对虾的微生物

文献类型: 中文期刊

作者: 陶飞燕 1 ; 潘创 2 ; 陈胜军 2 ; 胡晓 2 ; 邓建朝 2 ; 李春生 2 ; 荣辉 2 ; 王悦齐 2 ;

作者机构: 1.上海海洋大学食品学院

2.中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部水产品加工重点实验室/国家水产品加工技术研发中心

关键词: 凡纳滨对虾;微冻;高通量测序;微生物分析

期刊名称: 南方水产科学

ISSN:

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 104-113

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 文章以微冻贮藏的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)整虾、去头尾虾和虾仁的表面微生物作为研究对象,采用高通量测序技术鉴定不同贮藏时期样品菌群的组成及变化情况。结果显示:1)各组样品的操作分类单元(Operational taxonomic unit, OTU)随贮藏时间的推移呈下降趋势,贮藏4周后虾仁的OTU数量最少,整虾与去头尾虾的OTU数量相对较多;2)各组样品的赵氏指数(Chao)、艾斯指数(ACE)和香农指数(Shannon)逐渐减小,辛普森指数(Simpson)增加,即贮藏过程中样品菌群丰度和多样性逐渐降低;3)在属水平上,弧菌属(Vibrio)是各组样品的最初优势菌,弓形菌属(Arcobacter)在去头尾虾和整虾中存在较多。微冻4周后,假单胞菌属(Pseudomonas)、希瓦氏菌属(Shewanella)和嗜冷杆菌属(Psychrobacter)成为优势腐败菌;4)属水平上的热图和关键物种分析显示,3种形式的对虾菌种组成和比例有所差异。综上,凡纳滨对虾贮藏时间和形态不同,其表面微生物种类、丰度等差异显著,在冷链流通过程中需要针对性地抑制微生物优势以保障产品品质。

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