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与猪流行性腹泻病毒M蛋白互作的宿主蛋白的鉴定

文献类型: 中文期刊

作者: 王瑞阳 1 ; 于瑞嵩 1 ; 陈冰清 1 ; 李凤平 1 ; 谢春芳 1 ; 司伏生 1 ; 董世娟 1 ; 李震 1 ;

作者机构: 1.上海海洋大学水产与生命学院;上海市农业科学院畜牧兽医研究所;上海农业遗传育种重点实验室;上海种猪工程技术研究中心

关键词: 免疫共沉淀;猪流行性腹泻病毒;CDC42;eIF3L;膜蛋白;蛋白互作

期刊名称: 微生物学通报

ISSN: 0253-2654

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 1434-1442

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【背景】猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)膜蛋白(M)在病毒粒子的组装、膜融合和病毒复制等方面具有重要的作用,但M蛋白与宿主细胞的互作机制尚不清楚。【目的】利用免疫沉淀技术和液质联用技术筛选细胞内与PEDVM蛋白相互作用的蛋白,为揭示M蛋白在病毒增殖过程中发挥的功能提供研究基础。【方法】将MOI=0.1的PEDV DR13疫苗株接种于长成单层的Vero细胞,感染36 h后,收集细胞并进行裂解。利用抗M的单克隆抗体沉淀与M相互作用蛋白复合物,通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行鉴定并利用细胞功能富集分析(Gene ontology,GO)对感染组鉴定到的细胞蛋白进行分析,确定两个细胞内源性蛋白为候选蛋白,进行免疫共沉淀(Co-IP)验证和共定位分析。【结果】基于鉴定蛋白的肽段数的方法分析显示,感染组与对照组相比,鉴定了218个与M蛋白相互作用的细胞内源性蛋白,分别与蛋白质合成、代谢、细胞信号通路转导等密切相关,选择细胞分裂周期蛋白42 (Cell division cycle 42,CDC42)、真核翻译起始因子3亚基L蛋白(eIF3L)为候选蛋白进行Co-IP(Co-immunoprecipitation)验证和共定位分析,结果证实CDC42、eIF3L蛋白分别与M蛋白在细胞内存在相互作用。【结论】鉴定出PEDV M蛋白能够与宿主细胞CDC42和eIF3L蛋白相互作用,并鉴定出其他可能与M蛋白发生相互作用的宿主蛋白60个,为开展PEDV与宿主细胞蛋白相互作用研究提供了重要理论依据。

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