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沪油15中两个AP2/ERF-B1亚族转录因子的克隆与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 庄静 1 ; 彭日荷 2 ; 高峰 2 ; 付晓燕 3 ; 朱波 4 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院作物育种栽培研究所

2.上海市农业科学院生物技术研究所

3.扬州大学艺术学院

4.吉林大学畜牧兽医学院

关键词： AP2/ERF;B1亚族;转录因子;克隆;沪油15

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2009 年 23 卷 03 期

页码： 83-89+101

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用油菜EST数据库,以拟南芥ERF-B1亚族转录因子序列为探针,电子克隆拼接得到2个cDNA序列(BnaERFB1-1和BnaERFB1-2),通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因。克隆转录因子BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-Hy15与电子克隆的序列差异很小,分别只有2个和6个氨基酸位点不同,且都没有内含子。从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、序列比对、功能域、二级和三级结构等方面进行了分析,结果显示,BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-Hy15转录因子属于AP2/ERF家族中的ERF-B1亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与拟南芥atERF7相似。EST丰度分析显示,BnaERFB1-1的表达主要集中在种子中,而BnaERFB1-2的表达则主要集中在分生组织中。

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