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陆地棉(Gossypium hirsutum)光敏色素B基因(GhPHYB)克隆及其生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李建平 1 ; 郝晓燕 2 ; 陈勋基 2 ; 陈果 2 ; 罗城 2 ; 刘海峰 2 ; 黄全生 2 ;

作者机构: 1.中国彩棉(集团)股份有限公司

2.中国彩棉(集团)股份有限公司;新疆农业科学院核技术生物技术研究所

关键词: 陆地棉;光敏色素B;克隆;RNAi干涉

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2015 年 13 卷 08 期

页码: 1725-1729

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究依据已公布的雷蒙德氏棉基因组测序结果,采用同源克隆的方法,以陆地棉TM-1幼苗为材料,利用RT-PCR技术克隆得到陆地棉光敏色素B基因(Gh PHYB)的c DNA序列。结果显示:该基因ORF全长3 582 bp,编码1 194个氨基酸;通过与已知的拟南芥光敏色素B氨基酸序列比对及蛋白结构预测,发现该基因包含植物光敏色素完整的结构,与烟草、拟南芥、水稻、小麦和玉米的氨基酸序列相似性分别为87.2%、77.9%、74.5%、74.5%和54.6%。同时,本研究还构建了Gh PHYB基因的RNAi干涉载体用于转化棉花,并通过构建棉花PHYB RNAi突变体了解陆地棉PHYB基因对棉花株型、开花期、产量、棉纤维品质、抗逆性等方面的调控作用。研究结果可为该基因今后应用于棉花生产奠定基础。

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