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菜心BcFLC1的SNP变异与选择性剪接

文献类型： 中文期刊

作者： 陶鹏 1 ; 赵彦婷 1 ; 钟新民 1 ; 岳智臣 1 ; 雷娟利 1 ; 李必元 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 菜心(Brassica papachinensis);BcFLC1;SNP变异;选择性剪接

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 18 卷 022 期

页码： 7429-7435

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨菜心极易抽薹开花的分子机制,本研究以早熟类型的'四九菜心'为研究材料,参考大白菜基因组分析了菜心开花抑制基因BcFLC1的转录组SNP情况,鉴定了3个纯合SNP位点.其中一个SNP定位在6号内含子(I6)的剪接供体位点“GT”上,在菜心中突变为“AT”.研究发现菜心BcFLC1剪接位点变异导致其在pre-mRNA加工中发生了选择性剪接,产生了6种剪接异构体,并分析了每种剪接方式的频率.预测了菜心6种BcFLC1剪接异构体的蛋白产物,显示这些蛋白产物均异常,缺失6号或7号外显子以及氨基酸片段的插入.最后比较了大白菜、结球甘蓝以及菜心中FLC1的SNP变异与选择性剪接.本研究分析了菜心BcFLC1的SNP变异及其诱导的选择性剪接的特征,为阐释了菜心极易抽薹开花的分子机制提供了理论依据.

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