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基于高通量测序技术分析麝香草酚处理禾谷镰孢菌后转录组学的变化

文献类型： 中文期刊

作者： 高弢 1 ; 史建荣 2 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所;省部共建国家重点实验室培育基地——江苏省食品质量安全重点实验室;农业部农产品质量安全控制技术与标准重点实验室

2.;江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所;省部共建国家重点实验室培育基地——江苏省食品质量安全重点实验室;农业部农产品质量安全控制技术与标准重点实验室;

关键词： 禾谷镰孢菌;麝香草酚;转录组;高通量测序

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2017 年 06 期

页码： 1257-1265

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物源化合物麝香草酚能够破坏禾谷镰孢菌细胞膜的完整性来抑制病原菌的生长,但其具体的作用靶标尚不明确。为发掘禾谷镰孢菌中麝香草酚潜在作用靶标,本研究以禾谷镰孢菌标准菌株(PH-1)为材料,采用新一代高通量测序技术Illumina Hiseq 2000对麝香草酚处理及未处理的禾谷镰孢菌进行转录组测序分析,利用生物信息学方法对差异表达基因的功能进行研究,同时利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对部分关键基因进行验证。结果表明,禾谷镰孢菌经过50μg/ml麝香草酚处理12 h后,共检测到1 477个基因的表达量发生了变化,其中下调基因数目为772个,上调基因数目为705个。这些差异表达基因参与多种代谢途径,表明麝香草酚对禾谷镰孢菌的作用是一个多基因参与的协同调控过程。qRT-PCR验证部分基因上调下调结果与转录组分析结果一致。本研究通过二代高通量转录组测序技术分析麝香草酚处理后禾谷镰孢菌的差异表达基因,为进一步揭示麝香草酚作用的分子机制,挖掘作用靶标提供基础资料。

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