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传统中草药高通量测序技术RNA-seq及lncRNA挖掘的应用策略

文献类型： 中文期刊

作者： 白晶 1 ; 李力恒 1 ; 孙尧 1 ; 扈韵绮 1 ; 付博 1 ;

作者机构： 1.黑龙江中医药大学;黑龙江省农业科学院博士后科研工作站东北林业大学博士后科研流动站;黑龙江省农业科学院畜牧研究所

关键词： 传统中草药;转录组;高通量测序;长非编码RNA

期刊名称： 中医药信息

ISSN： 1002-2406

年卷期： 2014 年 02 期

页码： 20-23

摘要： 中草药作为中国传统中医特有药物已有上千年的历史,然而对中草药资源关键生物学过程中的功能基因挖掘却刚刚起步。lncRNA功能研究越来越引起人们的重视,结合RNA-seq技术研究中草药转录组中lncRNA功能,有望揭示中草药的生长、发育、代谢等生物学过程中的分子机制。综述了RNA-seq高通量测序及在中草药转录组测序中的应用策略,简述了lncRNA主要生物学功能及分析方法,并对RNA-seq技术和lncRNA生物信息学分析方法中存在的问题进行了简要讨论。

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[1]中药转录组学及lncRNA挖掘的应用研究. 白晶,扈韵绮,孙尧,李力恒,孟庆勇. 2013

[2]白菜中BrpR8长非编码RNA表达特性. 岑曦,李丹丹,刘自广,刘春晓,杨贺,黄小庆,李爽,汤川泰,吴娟. 2019

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