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低温碱性蛋白酶QDAPr的生物信息学分析及同源模建

文献类型： 中文期刊

作者： 郝建华 1 ; 袁翠 1 ; 王跃军 1 ; 孙谧 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所海洋酶工程重点实验室

关键词： 碱性蛋白酶;生物信息学;同源模建

期刊名称： 生物信息学

ISSN： 1672-5565

年卷期： 2006 年 4 卷 02 期

页码： 62-64

摘要： 对一株来自黄海的假单胞杆菌QD80所产的碱性蛋白酶QDAPr进行了生物信息学分析,并用生物信息学软件对其空间结构进行了模拟,同时对模建结果进行了结构质量的分析和检测。最后对模建的结果进行了初步的实验验证。结果表明:该碱性蛋白酶的等电点为8.52,外源性氨基酸为32.9%,二级结构中α螺旋占5.88%,β折叠片占14.6%,与铜绿假单胞菌的碱性蛋白酶的同源性为76%。三维结构检测表明此模型的结构符合立体化学和生物学功能。同源性分析表明该模建模型含有HEXXHXUGUXH的基元(motif),通过BrAc修饰实验初步验证了活性中心的功能。

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