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合浦珠母贝微卫星DNA标记分离与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李小宁 1 ; 张殿昌 2 ; 朱彩艳 2 ; 苏天凤 2 ; 江世贵 2 ;

作者机构： 1.上海海洋大学

2.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词： 光合细菌;浓缩制剂;保藏;存活率

期刊名称： 福建水产

ISSN： 1006-5601

年卷期： 2009 年 01 期

页码： 48-54

摘要： 采用生物素标记的(CA)15、(AG)12、(ACA)15、(GATA)8、(GATT)75个探针和磁珠富集法构建马氏珠母贝(Pinctada martensii Dunker)基因组微卫星富集文库。随机挑选500个进行PCR筛选,得到138(27.6%)个候选克隆,测序分析发现130个克隆含有微卫星基重复单元。进一步通过序列比对,最终获得109个具有特异微卫星序列的阳性克隆,其中包含179个微卫星DNA结构域。获得的微卫星序列中,属于完全型序列的有154条,不完全型重复型序列有19条,复合型重复序列有6条。序列长度为70~490bp,平均295 bp。微卫星核心序列两碱基重复3到39次,绝大多数序列重复次数大于10。基于微卫星两端的侧翼序列设计并获得了13对能够在马氏珠母贝基因组有效扩增的微卫星引物。本研究旨为进一步开展马氏珠母贝分子育种及资源评价分析提供基础资料。

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