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哈氏黄瓜NAC转录因子的鉴定及低温表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵艳青 1 ; 杜建厂 1 ; 王盼乔 1 ; 秦晓东 1 ; 陈劲枫 1 ;

作者机构: 1.南京农业大学园艺学院;江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所

关键词: 黄瓜;哈氏黄瓜;NAC转录因子;低温胁迫;基因表达

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2019 年 07 期

页码: 1303-1319

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以哈氏黄瓜(Cucumis sativus var. hardwickii)为试验材料,基于全基因组测序结果,利用生物信息学分析方法,鉴定获得77个NAC转录因子,其结构高度保守,序列长度在151~653个氨基酸之间,在7条染色体中呈非均匀分布;理论等电点在4.54~9.10之间;大部分转录因子定位在细胞核和细胞质膜上;系统发生分析显示所有NAC转录因子聚类为6个亚家族,其中亚家族Ⅲ序列结构较为多样性;进化分析发现NAC转录因子存在片段重复和串联重复等复制模式,没有发生近代的全基因组复制事件,并在进化过程中受到纯化选择作用;NAC转录因子基因在哈氏黄瓜幼苗根中表达量最高,其次为雌花和叶片;荧光定量分析发现,低温处理下,检测的15个NAC基因中有12个显著上调表达,3个下调表达,并存在一组表达量差异明显的HdNAC32–Hd ANC47片段复制基因对。由此可知NAC转录因子在受低温胁迫的哈氏黄瓜中发挥重要的转录调控作用。

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