您好，欢迎访问上海市农业科学院 机构知识库！
上海市农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

基于全基因组系统发生的草菇基因家族显著扩增

文献类型： 中文期刊

作者： 龚明 1 ; 谭琦 2 ; 陈明杰 2 ; 鲍大鹏 2 ; 汪虹 2 ;

作者机构： 1.国家食用菌工程技术研究中心

2.国家食用菌工程技术研究中心,农业部南方食用菌资源利用重点实验室,上海市农业遗传育种重点开放实验室,上海市农业科学院食用菌研究所

关键词： 草菇;自溶;基因扩增;全基因组;异常代谢

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2014 年 54 卷 09 期

页码： 992-997

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】从基因组层次研究草菇低温自溶异常代谢的分子特征。【方法】对21个真菌物种进行全基因组系统发生分析,进而选取其中具有代表性的物种进行比较基因组学分析,系统研究草菇异常代谢分子特征。【结果】全基因组系统发生分析结果显示草菇位于草腐菌所形成簇的底端。基于全基因组系统发生树,由于担子菌和子囊菌属于完全不同的演化路径,所以选取担子菌中具有代表性的9个物种进行比较基因组学分析,结果显示相比于其它草腐菌,草菇基因家族具有一定的收缩趋势。进一步对不同范畴的基因家族数目进行比较,结果显示3个大于200的草菇基因家族(fam1、fam4和fam6)分别发生了显著扩增,且在总数上也显著高于其它物种,表明草菇的这一分子特征与其异常代谢相关。【结论】3个草菇基因家族(>200)显著扩增提示其特定基因家族功能加强,很可能与草菇低温自溶密切相关。

  • 相关文献

[1]草菇蛋白酶的鉴定. 李世贵,陈明杰,凌霞芬. 2000

[2]草菇蛋白酶的分离、纯化及等电点的测定. 李世贵,陈明杰. 2003

[3]草菇全基因组框架图. 鲍大鹏,赵国屏,谭琦,王升跃,陈明杰,郑华军,张劲松,朱永强,汪虹,康慧,陈祥,林楠,冯爱萍. 2010

[4]沪农灵芝1号全基因组分析和演化比较. 龚明,鲍大鹏,唐传红,张劲松. 2016

[5]mRNA差别显示技术分离草菇低温诱导基因. 陈明杰,谭琦,曹晖,王南,黄为一,潘迎捷. 2001

[6]草菇冷诱导相关基因及其上游序列结构分析. 孙晓红,上海市农业遗传育种重点实验室,冯爱萍,汪虹,陈明杰,潘迎捷. 2005

[7]草菇低温应答研究. 陈明杰,谭琦,曹晖,王南,凌霞芬,黄为一,潘迎捷. 2001

[8]草菇不同菌株同工酶技术研究初探. 凌霞芬,范苹. 1998

[9]草菇S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶基因上游序列的克隆和分析. 孙晓红,陈明杰,汪虹,冯爱萍,潘迎捷. 2010

[10]草菇谷胱甘肽还原酶基因受低温影响的表达研究. 赵妍,马丹丹,姜威,颜素雅,陈明杰. 2015

[11]低温胁迫下草菇海藻糖磷酸化酶基因表达变化研究. 李亚鹏,陈明杰,赵妍,汪虹. 2014

[12]草菇不时栽培方式试验. 黄建春,朱建标,陶雪娟. 1998

[13]草菇不同菌株木聚糖酶xyn基因的表达及其酶活性分析. 王孟兰,赵妍,陈明杰,汪虹. 2014

[14]草菇锰过氧化物酶编码基因生物信息学分析及其转录水平和酶活性的测定. 朱刚,吴林,陈明杰,汪虹,谭琦,鲍大鹏. 2013

[15]草菇冷诱导基因Cor4在低温下表达变化的研究. 乔娜,汪虹,陈明杰. 2009

[16]草菇S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶基因的克隆和序列分析. 孙晓红,陈明杰,汪虹,冯爱萍,潘迎捷. 2010

[17]草菇VH3菌株及其单孢后代间的差异分析. 林锋,赵妍,陈明杰,颜素雅,王丽宁,黄金丽. 2015

[18]低温对草菇高半胱氨酸水解酶代谢途径基因表达变化的影响. 吴国铭,汪虹,陈明杰,鲍大鹏,万鹏. 2014

[19]草菇基因组中11个漆酶同源基因的生物信息学分析及铜离子对其表达的影响. 吴林,朱刚,陈明杰,汪虹,鲍大鹏. 2014

[20]草菇育种方法及相关分子标记研究进展. 林锋,李国贤,赵妍,汪虹,陈明杰. 2014

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：上海市农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台