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翘嘴红鲌PEPCK基因的克隆和序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 戈贤平 1 ; 俞菊华 2 ; 吴婷婷 2 ;

作者机构： 1.南京农业大学无锡渔业学院

2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

关键词： 基因克隆;快速扩增cDNA末端;磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK);翘嘴红鲌;序列同源性

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2006 年 13 卷 03 期

页码： 389-396

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR和RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)法,分离和克隆翘嘴红(Erythroculter ilishaeformis)磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)基因的全序列,得到2 564 bp[不含poly(A)]的全长cDNA,包括111 bp 5′非翻译区,1 911 bp阅读框以及含Poly(A)信号AATAAA的542 bp3’非翻译区[不包括Poly(A)]。阅读框共编码636个氨基酸,计算的分子量为69.65 kD。该序列含有PEPCK特有的结合草酰乙酯的结构域以及与GTP三磷酸链和Mg2+结合的激酶1和2基序。与其他鱼PEPCK的相似性高达83%~96%,和爪蟾、变形虫等其他动物的相似性为50%~69%。

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