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三穗鸭体尺与屠宰性状的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 伍革民 1 ; 韩雪 1 ; 吴松成 1 ; 冯宇隆 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 三穗鸭;全基因组关联分析;体尺性状;屠宰性状;候选基因

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2025 年 54 卷 006 期

页码： 135-143

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了筛选出影响三穗鸭体尺和屠宰性状的遗传位点和功能基因，以655只160日龄三穗鸭为研究对象，测定体尺（体斜长、颈长）和屠宰性状（宰前活质量、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率）等表型数据，通过全基因组关联分析（10×深度）获取个体单核苷酸多态性（SNP）基因型，基于PLINK 1.9进行质控分析，利用GEMMA执行混合线性模型关联分析，并通过clusterProfiler对显著关联位点进行KEGG候选基因功能富集分析。结果表明，分别筛选到与体斜长、颈长、宰前活质量、屠体质量、全净膛质量、胸腿肌率显著关联的SNP位点207、78、64、66、68、96个，分别注释到50、31、32、40、27、37个候选基因。KEGG富集分析结果表明，与体斜长、颈长、宰前活质量、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率关联的候选基因分别富集到16、10、12、11、13、22条KEGG通路。其中，神经活性配体-受体相互作用与6个性状均有关，钙信号通路与体斜长、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率有关，MAPK信号通路与宰前活质量、屠体质量和全净膛质量有关。LOC119717855、GPR50、GRM7、GABRB2、GABRG2、LOC101800857等基因是体斜长的关键候选基因，GRIK2、BNIP1等基因是颈长的关键候选基因，TAF2和NRK基因是宰前活质量、屠体质量和全净膛质量的关键候选基因，SLC8A1基因是屠体质量和全净膛质量的关键候选基因，HTR2A、QRFPR、NPVF和UTS2R等基因是胸腿肌率的关键候选基因。综上，影响三穗鸭体尺与屠宰性状的主要KEGG通路为神经活性配体-受体相互作用、钙信号等信号通路，关键候选基因为LOC119717855、GPR50、GRIK2、TAF2等。

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