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鲥(鱼侯)淀不同基质附着细菌群落结构特征及PICRUSt功能预测分析

文献类型: 中文期刊

作者: 邓茹 1 ; 陈曦 2 ; 裘丽萍 2 ; 孟顺龙 1 ; 陈家长 2 ;

作者机构: 1.水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学)/农业农村部淡水水产种质资源重点实验室(上海海洋大学)/农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心(上海海洋大学)

2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部水产品质量安全环境因子风险评估实验室(无锡)/中国水产科学研究院内陆渔业生态环境和资源重点开放实验室

关键词: 附着细菌;生物膜;高通量测序;PICRUSt功能预测;微生物群落

期刊名称: 淡水渔业

ISSN:

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 13-22

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解湖泊生态系统中微生物群落的组成及其在生态系统中的作用和功能,实验基于高通量测序技术分析了鲥■淀芦苇、棕榈片、人工水草、网片四种不同基质附着细菌的群落结构组成,并采用PICRUSt对菌群功能进行了预测分析。结果显示:鲥■淀四种基质附着细菌群落组成丰富,共检测出38门91纲183目338科646属,优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、浮霉菌门(planctomycetes)。通过α-多样性分析发现四种基质附着细菌多样性指数大小依次为芦苇基质>棕榈片基质>人工水草基质>网片基质,丰富度依次为棕榈片基质>芦苇基质>网片基质>人工水草基质。进行PCoA分析和聚类分析,发现棕榈片基质与芦苇基质的附着细菌群落较为相似,而网片基质与人工水草基质较为相似。采用PICRUSt进行菌群功能预测分析,表明主要的COG功能包括氨基酸运输和代谢、细胞壁/细胞膜/膜结构的生物合成、能量产生和转换、信号转导机制、无机离子转运与代谢、碳水化合物的运输和代谢等共涉及22个功能基因家族。以上结果表明,生态修复中天然芦苇的微生物多样性最优且自我净化能力最强,其次是棕榈片。

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