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玉米钙依赖蛋白激酶全基因组鉴定及抗旱表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈果 1 ; 郝晓燕 1 ; 高升旗 1 ; 胡文冉 1 ; 赵准 1 ; 黄全生 1 ;

作者机构： 1.新疆农业科学院核技术生物技术研究所/新疆农作物生物技术重点实验室

关键词： 钙依赖蛋白激酶;全基因组鉴定;干旱胁迫;表达分析;玉米

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2023 年 60 卷 004 期

页码： 857-864

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]分析研究玉米钙依赖蛋白激酶全基因组鉴定及抗旱表达.[方法]使用NCBI Blast、DNAMAN和MotifScan等程序分析玉米钙依赖蛋白激酶CDPK的蛋白结构域和系统发育.采用Real-time RT-PCR方法分析CDPK基因在干旱胁迫处理玉米幼苗中的表达,评价CDPK基因对玉米干旱胁迫反应能力.[结果]鉴定出了在玉米中含有39 个CDPK基因.将CDPK基因分为4 个组.每个群体中的成员有共同的蛋白质基序和外显子及内含子结构,共同的进化起源.39 个玉米CDPK基因根据它们的系统发育关系分组,并锚定在特定的玉米染色体上.多数CDPK基因在玉米干旱胁迫中的表达水平发生改变,CDPK基因参与对干旱胁迫的响应.[结论]从玉米基因组数据库中鉴定出了39 个CDPK基因,大多数玉米CDPK基因在不同组织和不同发育阶段表现出不同的表达水平,CDPK基因在玉米发育中发挥不同的作用.多数CDPK基因在干旱胁迫下的表达量均发生变化.

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