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猪PKM2基因在肺炎支原体感染3D4/21细胞后的互作蛋白质鉴定与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵为民 1 ; 涂枫 1 ; 王丽 1 ; 任守文 1 ; 付言峰 1 ; 李碧侠 1 ; 徐小波 1 ; 陈哲 1 ; 方晓敏 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院畜牧研究所/江苏省农业种质资源保护与利用平台;农业部种养结合重点实验室

关键词: 猪;PKM2基因;肺炎支原体;互作蛋白质;免疫共沉淀

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 1381-1389

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过构建含有HA标签的PKM2过表达质粒转染3D4/21细胞,利用免疫共沉淀(Co-IP)与液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)技术分析与鉴定猪PKM2基因在肺炎支原体感染猪肺泡巨噬细胞3D4/21后的互作蛋白质,并对这些互作蛋白质进行GO与KEGG通路分析。结果显示肺炎支原体感染3D4/21细胞后,PKM2在mRNA水平和蛋白质水平上表达上调,其表达水平呈现剂量与时间依懒性。免疫共沉淀反应结果显示IP与IgG组共鉴定到72个蛋白质,这2组鉴定到的蛋白质数分别为60和19,其中7个蛋白质在2组中同时鉴定到。GO分析结果表明IP组的互作蛋白质主要参与了NAD代谢过程、NADH代谢过程、肌原纤维组装、NADH再生和葡萄糖代谢丙酮酸等生物过程,其中大多数与能量代谢有关。KEGG pathway分析结果表明互作蛋白质参与了致病性大肠杆菌感染、军团杆菌病、糖酵解/糖异生、丙酮酸代谢和癌症中的中枢碳代谢等通路,这些通路与细菌感染和能量代谢有关。

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