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3个奥利亚罗非鱼群体遗传多样性的RAPD分析和SCAR标记的转化

文献类型: 中文期刊

作者: 高风英 1 ; 叶星 1 ; 卢迈新 1 ; 黄樟翰 1 ; 张庭 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所

关键词: 奥利亚罗非鱼;遗传多样性;随机扩增多态DNA;SCAR标记

期刊名称: 上海水产大学学报

ISSN: 1004-7271

年卷期: 2008 年 17 卷 01 期

页码: 22-27

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 应用RAPD技术对3个奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)群体(奥利亚罗非鱼83系、新引进的红色奥利亚罗非鱼与奥利亚罗非鱼02系)进行遗传多样性分析。根据扩增结果统计获得群体内和群体间的遗传距离:奥利亚罗非鱼83系、红色奥利亚罗非鱼、奥利亚罗非鱼02系群体内的遗传距离分别为0.021 0,0.090 3和0.014 9;群体间的遗传距离以奥利亚罗非鱼83系与红色奥利亚罗非鱼群体间的最大,为0.135 1,奥利亚罗非鱼83系与奥利亚罗非鱼02系的遗传距离最小,为0.061 0,红色奥利亚罗非鱼与奥利亚罗非鱼02系群体间的遗传距离为0.121 8。利用MEGA3.1软件进行聚类分析,奥利亚罗非鱼83系与奥利亚罗非鱼02系首先聚为一支,然后再与红色奥利亚罗非鱼聚为一支。3个奥利亚罗非鱼群体总的Shannon多样性指数为:0.234 0,总的Nei基因多样性指数为0.152 7,3个群体的遗传分化指数(Gst)为0.507 1。上述结果说明这3个群体的群体内遗传变异较小,但群体间存在一定程度的遗传变异和遗传分化。对RAPD分析中所获得的6条特异带进行SCAR转化。S97800和S4691400两个特异片段成功转化为SCAR标记。这些标记可作为鉴别3个奥利亚罗非鱼群体的遗传标记,并将为今后的选择育种提供分子标记。

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