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猪肥胖基因ob近端启动子的生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李毅 1 ; 张嘉保 1 ; 赵志辉 2 ; 武霞 2 ; 张树敏 3 ;

作者机构: 1.吉林大学实验动物中心

2.吉林大学畜牧兽医学院

3.吉林省农科院畜牧分院

关键词: ob基因;转录调控;生物信息学

期刊名称: 广西农业生物科学

ISSN: 1008-3464

年卷期: 2006 年 25 卷 S1 期

页码: 37-39

收录情况: CSCD

摘要: 通过检索网上数据库资料,获得ob的转录本信息;利用F irstEF等预测程序分析并获得ob的启动子序列,并使用M atlspector程序对启动子序列的转录因子结合位点进行预测。结果表明,目前已知的ob转录本中,5′UTR区最长的序列为AF 492499(G enB ank登录号);利用F irstEF等预测程序分析成功获得了长度为529 bp的猪ob的启动子序列,M atlspector程序分析该启动子中含有24个转录因子结合位点,包括TATA盒、SP 1、C/EBP等多种顺式反应元件。通过分析获得了猪ob启动子序列及其转录调控信息。

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