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PRRSV HNHK3-2021毒株的ORF5和ORF7序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 范悦轩 1 ; 马佳镁 1 ; 黄春媛 2 ; 郑佳馨 2 ; 陈素贞 1 ; 张艳 2 ; 刘光亮 1 ; 曹宗喜 1 ;

作者机构: 1.新疆农业大学动物医学学院

2.海南省农业科学院畜牧兽医研究所/海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征;遗传进化;ORF5;ORF7

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2024 年 005 期

页码: 1292-1300

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】研究海南猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的流行病学特征和遗传变异规律。【方法】采集海南省海口市及周边地区样品,分离出PRRSV HNHK3-2021毒株,并测定NSP2基因以及ORF5和ORF7基因序列,采用Lasergene 7.1进行序列比对分析,用MEGA-X进行遗传演化分析。【结果】分离出的PRRSV HNHK3-2021株为美洲型毒株,PRRSV HNHK3-2021株和EF112447 HEB1、EU109503 GD、EU624117 XH-GD的ORF5和ORF7的核苷酸相似性较高,分别为99.2%~99.3%和99.5%~100%,推导氨基酸相似性为99%~99.5%和100%;PRRSV HNHK3-2021株和EU864232 SHB、AY262352_HB-2(sh)2002、AY656990 Abst-1、AY032626 CH-1a、EU807840 CH-1R的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为87.1%~96.4%和91.4%~97.3%,推导氨基酸的相似性为86.6%~93%和91.9%~97.6%;PRRSV HNHK3-2021株和JN654459 NADC30、KP860909 FJZ03、MH068878 SD17-38、AY881994 FJ-1的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为85.4%~87.1%和89%~91.4%。氨基酸的相似性为86.1%~87.1%和89.5%~91.9%。【结论】RRSV HNHK3-2021毒株和EU624117 XH-GD具有最近的遗传距离。

  • 相关文献

[1]PRRSV HuN-2011株ORF5和ORF7基因的序列分析. 贺冬梅,谭树义,陈朝喜,徐静伟,田语诗,魏玉情,曹宗喜. 2017

[2]GENETIC DIVERSITY ANALYSIS OF THE ORF5 GENE IN PORCINE REPRODUCTIVE AND RESPIRATORY SYNDROME VIRUS SAMPLES FROM SOUTH CHINA. Cao, Zong-Xi,Jiao, Pei-Rong,Qin, Hong-Yang,Kong, Liu-Wu,Pan, Quan-Hui,He, Yi-Min,Zhang, Gui-Hong,Cao, Zong-Xi,Huang, Yu-Mao. 2012

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