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猪源新城疫病毒SP13株的F基因克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郑腾 1 ; 程龙飞 2 ; 李志方 1 ; 柯美峰 3 ; 黄瑜 2 ; 李文杨 2 ; 施少华 2 ;

作者机构: 1.福建出入境检验检疫局

2.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

3.福州大北农生物技术有限公司

关键词: 猪源;新城疫病毒;F基因;克隆;序列分析;系统发育分析

期刊名称: 福建农林大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-5470

年卷期: 2007 年 36 卷 03 期

页码: 259-263

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR方法对猪源新城疫病毒(NDV)SP13株的F基因进行了扩增与克隆,并测定出F基因的核苷酸全序列,推导出氨基酸序列.F基因全长为1662 bp,单一的开放阅读框,编码553个氨基酸的长肽,裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,与弱毒株在这一区域的序列(112G-R/K-Q-G/S-R-L117)相符;F蛋白有6个潜在的糖基化位点和13个Cys残基位点,其疏水构型有3个强疏水区.通过同源率、系统发育、致病性、疏水性和抗原性等比较分析的结果表明,SP13与LaSota、Clone 30株不但同源性达到99.9%,而且在致病性、疏水性和抗原性等方面也极为相似.

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