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津南芹菜EST-SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 兰青阔 1 ; 李欧静 1 ; 张继波 2 ; 赵新 1 ; 朱珠 1 ; 陈锐 1 ; 徐石勇 1 ; 王永 1 ; 郭永泽 1 ;

作者机构: 1.天津市农业质量标准与检测技术研究所

2.天津市宏程芹菜研究所

关键词: 芹菜;SSR标记;指纹图谱;遗传多样性

期刊名称: 天津农业科学

ISSN: 1006-6500

年卷期: 2012 年 18 卷 05 期

页码: 7-11

摘要: 以天津市津南11个芹菜育种材料为研究对象,利用EST-SSR分子标记技术构建津南芹菜分子指纹图谱,并用于遗传多样性分析。从GenBank数据库查询芹菜EST序列1122条,使用BatchPrimer3在线软件扫描分析获得194个候选EST-SSR位点,并设计141对SSR-PCR引物。选择其中47对引物进行多态性分析,确认8对引物具有多态性。构建基于Excel格式的津南芹菜EST-SSR指纹图谱,包括8对引物在供试材料中扩增到的44条多态性条带信息。遗传多样性分析显示,供试材料间遗传相似系数介于0.409~0.864之间,平均为0.664。本研究建立的津南芹菜EST-SSR指纹图谱稳定有效,可用于芹菜种质资源鉴定和品种真实性检测。

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