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基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭燕 1 ; 乔大河 1 ; 杨春 1 ; 李燕 1 ; 陈正武 1 ; 陈娟 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院茶叶研究所

关键词： 古茶树;SNP;遗传结构;进化关系

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 26-36

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 贵州久安分布着大量的古茶树资源。为了明晰这些茶树资源间的遗传关系,本研究以分布于久安5个不同区域的100份古茶树为材料,首先利用GBS(genotyping by sequencing)技术对它们的全基因组SNP进行了鉴定,然后基于鉴定到的SNP进行了系统进化树构建、主成分分析以及遗传结构分析。100份古茶树材料共获得548597个高质量SNP,并对这些SNP进行了变异类型注释。系统进化树、主成分分析以及遗传结构分析的结果高度一致,结果表明同一区域内的材料间亲缘关系较近;100份资源可以分为3个类群;古茶园(G)的材料与其他4个区域的材料遗传背景差异较大,这4个区域的资源可能有相同的亲本来源。

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