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菜心光敏色素B基因BcPHYB的鉴定与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 岳智臣 1 ; 陶鹏 1 ; 赵彦婷 1 ; 雷娟利 1 ; 李必元 1 ;

作者机构: 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 菜心(Brassica parachinensis);BcPHYB;InDel变异;选择性剪接

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2020 年 017 期

页码: 5570-5575

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 菜心在长日照或短日照条件下均可抽薹开花,为解释菜心开花对光周期不敏感的分子机制,本研究以'四九菜心'为材料,利用菜心叶片转录组测序数据鉴定了光敏色素B基因(BcPHYB).通过构建系统树,发现菜心BcPHYB类似于早花大白菜BraPHYB2,并且在5'UTR中存在20 bp的InDel.菜心BcPHYB在pre-mRNA加工中存在着选择性剪接,一部分转录本会保留1号、2号或3号内含子,导致相应的BcPHYB蛋白产物中插入或者缺失部分氨基酸序列片段.本研究分析了菜心BcPHYB的InDel变异与选择性剪接情况,为阐释菜心对光周期不敏感的开花分子机制提供了帮助.

  • 相关文献

[1]菜心BcFLC1的SNP变异与选择性剪接. 陶鹏,赵彦婷,钟新民,岳智臣,雷娟利,李必元. 2020

[2]大白菜BrSPS1Fb基因剪接受体位点变异及其对剪接的影响. 陶鹏,岳智臣,赵彦婷,雷娟利,李必元. 2021

[3]CMS结球甘蓝剪接异构体BoKIN1-2的鉴定及其表达研究. 陶鹏,钟新民,李必元,王五宏,岳智臣,雷娟利. 2015

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